Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SmsP97355 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SmsP97355 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SmsP97355 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SmsP97355 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmsP97355 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SmsP97355 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmsP97355 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms