Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp1P97350 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms