Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx3P81067 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx3P81067 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx3P81067 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms