Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tp53bp1P70399 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Tp53bp1P70399 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tp53bp1P70399 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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