Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SbdsP70122 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SbdsP70122 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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