Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crnkl1P63154 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms