Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab3cP62823 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms