Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SnrpfP62307 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SnrpfP62307 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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