Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rps29P62274 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms