Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms