Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PlnP61014 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PlnP61014 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms