Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Csrnp1P59054 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms