Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rhbdl3P58873 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms