Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Paxbp1P58501 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms