Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtdsplP58465 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms