Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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Mmp20P57748 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Mmp20P57748 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp20P57748 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Mmp20P57748 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Mmp20P57748 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Mmp20P57748 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp20P57748 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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