Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms