Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GferP56213 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GferP56213 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
GferP56213 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
GferP56213 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
GferP56213 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
GferP56213 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms