Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Sh3bp1P55194 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Sh3bp1P55194 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Sh3bp1P55194 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Sh3bp1P55194 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Sh3bp1P55194 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Sh3bp1P55194 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp1P55194 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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