Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aqp4P55088 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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