Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TspoP50637 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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TspoP50637 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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TspoP50637 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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TspoP50637 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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TspoP50637 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TspoP50637 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TspoP50637 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TspoP50637 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TspoP50637 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TspoP50637 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TspoP50637 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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TspoP50637 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TspoP50637 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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TspoP50637 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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