Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxc13P50207 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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