Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PtpreP49446 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpreP49446 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PtpreP49446 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PtpreP49446 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpreP49446 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpreP49446 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PtpreP49446 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PtpreP49446 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PtpreP49446 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PtpreP49446 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PtpreP49446 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PtpreP49446 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtpreP49446 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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