Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfsf9P41274 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms