Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VhlP40338 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VhlP40338 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VhlP40338 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms