Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtlP38585 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtlP38585 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtlP38585 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtlP38585 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtlP38585 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtlP38585 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TtlP38585 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TtlP38585 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtlP38585 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtlP38585 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtlP38585 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TtlP38585 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtlP38585 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtlP38585 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtlP38585 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtlP38585 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtlP38585 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtlP38585 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtlP38585 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtlP38585 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtlP38585 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TtlP38585 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtlP38585 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TtlP38585 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtlP38585 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtlP38585 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtlP38585 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtlP38585 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TtlP38585 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TtlP38585 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TtlP38585 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TtlP38585 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TtlP38585 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TtlP38585 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
TtlP38585 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TtlP38585 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TtlP38585 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms