Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Grin1P35438 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin1P35438 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin1P35438 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Grin1P35438 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms