Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoc1P34928 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms