Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VtnP29788 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VtnP29788 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
VtnP29788 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
VtnP29788 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VtnP29788 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VtnP29788 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VtnP29788 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VtnP29788 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VtnP29788 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VtnP29788 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VtnP29788 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VtnP29788 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VtnP29788 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VtnP29788 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VtnP29788 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VtnP29788 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VtnP29788 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VtnP29788 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VtnP29788 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms