Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RxraP28700 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RxraP28700 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RxraP28700 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms