Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Defa5P28312 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa5P28312 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms