Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa2P28309 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms