Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms