Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
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