Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U2af2P26369 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms