Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ChgaP26339 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChgaP26339 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms