Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pde6bP23440 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pde6bP23440 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pde6bP23440 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pde6bP23440 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pde6bP23440 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pde6bP23440 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pde6bP23440 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pde6bP23440 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pde6bP23440 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pde6bP23440 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6bP23440 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6bP23440 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6bP23440 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6bP23440 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6bP23440 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6bP23440 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6bP23440 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6bP23440 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6bP23440 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6bP23440 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6bP23440 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pde6bP23440 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6bP23440 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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