Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TP20293 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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TP20293 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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TP20293 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TP20293 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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