Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NelfeP19426 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NelfeP19426 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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