Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NefhP19246 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NefhP19246 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NefhP19246 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NefhP19246 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NefhP19246 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NefhP19246 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NefhP19246 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NefhP19246 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NefhP19246 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NefhP19246 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NefhP19246 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NefhP19246 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NefhP19246 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NefhP19246 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NefhP19246 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NefhP19246 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NefhP19246 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NefhP19246 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NefhP19246 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NefhP19246 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NefhP19246 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NefhP19246 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NefhP19246 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NefhP19246 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NefhP19246 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NefhP19246 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NefhP19246 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NefhP19246 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms