Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18528 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18528 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18528 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18528 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18528 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18528 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18528 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18528 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P18528 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18528 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18528 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18528 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18528 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18528 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18528 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18528 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18528 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18528 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18528 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18528 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18528 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18528 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18528 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18528 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18528 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18528 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18528 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18528 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18528 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18528 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18528 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P18528 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms