Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxb1P17919 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Hoxb1P17919 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Hoxb1P17919 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Hoxb1P17919 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Hoxb1P17919 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Hoxb1P17919 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Hoxb1P17919 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Hoxb1P17919 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Hoxb1P17919 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Hoxb1P17919 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Hoxb1P17919 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxb1P17919 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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