Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim30aP15533 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim30aP15533 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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