Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Amd1P0DMN7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Amd1P0DMN7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Amd1P0DMN7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Amd1P0DMN7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Amd1P0DMN7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Amd1P0DMN7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Amd1P0DMN7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Amd1P0DMN7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Amd1P0DMN7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Amd1P0DMN7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Amd1P0DMN7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Amd1P0DMN7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Amd1P0DMN7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Amd1P0DMN7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Amd1P0DMN7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Amd1P0DMN7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Amd1P0DMN7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Amd1P0DMN7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Amd1P0DMN7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Amd1P0DMN7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Amd1P0DMN7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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