Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TtrP07309 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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TtrP07309 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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TtrP07309 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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TtrP07309 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TtrP07309 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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