Protein–RNA interactions for Protein: P01736

T-cell receptor beta chain V region PHDS203 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01736 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01736 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01736 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01736 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01736 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01736 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01736 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01736 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01736 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01736 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01736 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01736 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01736 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01736 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01736 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01736 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01736 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01736 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01736 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01736 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01736 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01736 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01736 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01736 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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