Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P01678 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01678 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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P01678 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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P01678 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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P01678 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P01678 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01678 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01678 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01678 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01678 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01678 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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P01678 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01678 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01678 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01678 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01678 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01678 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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P01678 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01678 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01678 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01678 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01678 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01678 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P01678 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P01678 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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