Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01672 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01672 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01672 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01672 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01672 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01672 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01672 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01672 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01672 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01672 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01672 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01672 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01672 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01672 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01672 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01672 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01672 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms