Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Foxq1O70220 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Foxq1O70220 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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