Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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